不用再被迫走剧情、卷入案件，只有身上会招来杀人案的奇怪体质在工作着、在提醒他。

于是「工藤新一」只是避开人群,对组织的事情抱着随便的态度,结果却被身为主角的自己反杀了。

没有了主角那么严密的控制,他也必须遵守反派一定会被打败的命运。

不过没关系，他是个bug，时间线回到了他刚醒来的时候。

「工藤新一」开始仔细观察着故事线的进展，他发现了g给工藤新一灌药的环节，当场打电话要求g直接杀掉他。

g照做了,于是时间线再一次重启。

所有重要人物的命运改变,都会导致整个世界重启。他花了数次循环的时间,将整个故事线和重要人物都整理了一遍。

这个世界分为四条故事线, 第一条是黑衣组织, 第二条是世良一家，包括后来的赤井和留在组织的宫野，第三条是主角工藤新一，第四条则是警校组。

在这四条故事线中，「工藤新一」尝试着用自己bug的身份去施加影响，他很快发现一切故事都是以第一次的故事线进展的。

只要在故事开始前，也就是工藤新一被琴酒一棍子敲晕、然后喝药变小之前，他所做的事情，不影响故事主线的进展，就可以继续下去，不用重启循环。

「工藤新一」开始了自己的尝试，首先是改变自己身为黑衣组织的boss所致力于的实验——永生。

一遍又一遍的尝试，去钻故事主线里的逻辑空子，利用现在作为黑衣组织boss的身份、将自己作为bug的影响一点点扩大。

说不清多少次轮回，他终于抢在宫野一家加入之前，中途改变了组织的实验方向，只有他本人和贝尔摩德一直保持着容貌不老，而雪莉/宫野志保成为了第一个从主线里脱离的重要人物。